Il ne faut pas exporter le PDF en planches, mais en pages. Ensuite, l'affichage des pages en vis-à-vis est simplement une propriété d'affichage du PDF qui doit être réglée dans Reader. Le PDF porte une méta-donnée qui indique le mode d'affichage préféré à l'ouverture dans Reader, pour ce document. On peut spécifier ce mode préféré à l'export dans InDesign sous "Deux pages (page de couverture)". Cette propriété appelle l'affichage demandé dans Reader (implicitement) à l'ouverture du document — mais n'importe quel PDF peut être consulté dans ce mode en le spécifiant directement dans Reader (explicitement).
Bref: utiliser les réglages tels que montrés dans l'image jointe produira un PDF qui s'affichera correctement à l'ouverture dans Reader (attention, impossible si le PDF est exporté en planches). La sélection du standard Compatibilité Acrobat 7 est indispensable pour que le PDF porte cette méta-donnée.